國家質量技術監督局于1998年4月發布了GB173223－1998《瓶裝飲用純凈水》和GB17324－1998《瓶裝飲用純凈水衛生標準》。在這兩個標準中，共設有感觀指標4項、理化指標4項、衛生指標11項。
1、感觀指標
感觀指標包括色度、濁度、臭味、肉眼可見物。這幾個指標是純凈水質量控制中最基本的指標，其制定的標準值參照了飲用水（即自來水）的標準，而大多廠家生產純凈水的水源是自來水，又經過粗濾、精濾和去離子凈化的流程，因此，一般純凈水都能達到國家標準所要求的數值。
2、理化指標
理化指標中較重要的是電導率和消耗量。電導率是純凈水的特征性指標，反映的是純凈水的純凈程度以及生產工藝的控制好壞。由于生活飲用水不經過去離子純化的過程，因此是不考察此項指標的。而對于純凈水來說“純凈"是其最基本的要求，金屬元素和微生物過高，都會導致電導率偏高。所以，電導率越小的水越純凈。
國標衛生指標中還有一項重要指標為亞硝酸鹽含量。亞硝酸鹽主要來源于水源附近土壤中的硝酸鹽，鹽堿地、大量施用硝酸鹽肥料以及缺鉬的土壤中硝酸鹽含量更高。在國標中規定亞硝酸鹽不得超過0.002mg/L。
3、微生物指標
微生物指標在國標中規定了菌落總數、大腸菌群、致病菌和霉菌、酵母菌4項。從近幾年對純凈水檢測的情況看，微生物指標是比較容易超標的指標之一。這是由于微生物污染體現在純凈水在生產加工、運輸和銷售過程等各個環節上。
在生產加工中，工人不注意個人衛生，回收瓶的清洗、消毒不嚴格，甚至一些廠家為降低成本，回收瓶蓋再次使用，由于回收瓶蓋的變形，造成瓶口不密封都有可能引起微生物污染。微生物的超標反映出水的污染程度。其中大腸桿菌達到一定指標，會引起人體腹瀉。
4、金屬指標
金屬元素指標在標準中規定了鉛、砷、銅的含量，鉛、砷要求不得超過0.1mg/L，其主要來源于受人類活動所影響的環境，包括土壤、河流的污染等等。鉛、砷為有毒有害元素，鉛可由呼吸道或消化道進入人體并蓄積在人體內，當血液中含鉛量為0.6～0.8mg/L時就會損害內臟，而砷的化合物會引起中毒，因此，它們的含量應該越小越好，而銅在標準中規定不得超過1.0mg/L，雖然銅不是有害元素，但也不是多多益善的物質，對于純凈水來說，更是衡量其純凈程度的標志之一。
5、有機物指標
有機物指標在國標中主要體現為（氯仿）和四氯化碳含量的規定。由于桶裝純凈水的質量問題主要集中在微生物檢測超標上，為了解決這一問題，不少廠家不是從生產工藝、質量管理入手，而是僅僅通的量來試圖解決純凈水的微生物污染問題，常用的消毒劑多為含氯消毒劑如二氧化氯等。桶裝純凈水由于加氯消毒可產生一些新的有機鹵代物，主要成分是（氯仿）和四氯化碳及少量的一氯甲烷、一溴二氯甲烷、二溴一氯甲烷以及溴仿等，統稱為鹵代烷。
經檢測，經過加氯消毒的飲用水、自來水中鹵代烷含量一般高于水源水。其中以和四氯化碳含量較高，對人體存在一定危害，在國標GB17324－1998中明確規定：飲用純凈水中三和四氯化碳的含量分別不得超過0.02mg/L、0.001mg/L。
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